Oui, de la même manière que si la créature choisie avait quitté le champ de bataille, cela n'empêche pas le sacrifice. Comme c'est précisé dans le Lien Gatherer :
Citation :
If the chosen creature leaves the battlefield, you can’t choose a new creature for Dauntless Bodyguard to protect. If you activate its last ability in this case, no creature gains indestructible.
Merci pour cette précision !!