Flibustière à voile volante
Faveur d'Érébos
Foudre

J'ai une flibustière en jeu, ayant exilée une carte de la main adverse lors de son arrivée en jeu.
Il se passe quoi si l'adversaire la cible avec une foudre et que je décide de +la sauver" avec une faveur d'erebos? La carte originellement exilée par la flibustière l'est toujours?

Oui, car la régénération est un effet de remplacement, ta créature n'est pas détruire mais régénérée, donc il n'arrive rien à la carte exilée.
Ca serait différent si tu lui donnais la survivance par exemple, dans ce cas la carte retournerait dans la main de son propriétaire, et tu pourrais en choisir une nouvelle (qui peut être la même) lorsqu'elle reviendrais.

et avec Changenuage? Je suppose que la carte exilée retourne dans la main adverse mais que du coup je peux l'exiler à nouveau lors du retour en jeu de ma créature?

Exactement.
Mais ton adversaire aura alors l’occasion de la jouer en réponse à la capacité d'arrivé en jeu.