L'effet de Heroic Intervention s'arrêtera à l'étape de nettoyage, qui est la dernière étape de la phase de fin de tour. Le Deputy arrive en début de phase de fin de tour, donc, Heroic Intervention fera toujours effet.
Note que dans l'exemple que tu décris, son Heroic Intervention ne sert à rien puisque tu peux cibler les Experiment One qui seront revenues :
Citation :
The set of permanents affected by Heroic Intervention is determined as the spell resolves. Permanents you begin to control later in the turn won’t gain hexproof and indestructible.